MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_015184	TCA	2	6	263518	263523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168586
4503	NC_015184	GGA	2	6	263541	263546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168586
4504	NC_015184	CCGA	2	8	263552	263559	25 %	0 %	25 %	50 %	325168586
4505	NC_015184	CTCAAC	2	12	263572	263583	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325168586
4506	NC_015184	CGA	2	6	263586	263591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4507	NC_015184	GCA	2	6	263622	263627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4508	NC_015184	GGC	2	6	263665	263670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4509	NC_015184	CGA	2	6	263720	263725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4510	NC_015184	ATC	2	6	263740	263745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168586
4511	NC_015184	TCATC	2	10	263835	263844	20 %	40 %	0 %	40 %	325168586
4512	NC_015184	CAG	2	6	263884	263889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4513	NC_015184	TCG	2	6	264008	264013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4514	NC_015184	CGC	3	9	264073	264081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168586
4515	NC_015184	CGG	2	6	264255	264260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4516	NC_015184	CGG	2	6	264314	264319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4517	NC_015184	GCG	2	6	264454	264459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4518	NC_015184	TCG	2	6	264503	264508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4519	NC_015184	TG	3	6	264543	264548	0 %	50 %	50 %	0 %	325168586
4520	NC_015184	A	6	6	264581	264586	100 %	0 %	0 %	0 %	325168586
4521	NC_015184	GCA	2	6	264590	264595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4522	NC_015184	GAAT	2	8	264677	264684	50 %	25 %	25 %	0 %	325168586
4523	NC_015184	TGA	2	6	264828	264833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168586
4524	NC_015184	GTT	2	6	264843	264848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168586
4525	NC_015184	GCC	2	6	264850	264855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168586
4526	NC_015184	GGC	2	6	264873	264878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4527	NC_015184	AGC	2	6	264887	264892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4528	NC_015184	GACG	2	8	264921	264928	25 %	0 %	50 %	25 %	325168586
4529	NC_015184	GCA	2	6	264975	264980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4530	NC_015184	CAT	2	6	265020	265025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168586
4531	NC_015184	CTGGTG	2	12	265081	265092	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325168586
4532	NC_015184	TCA	2	6	265127	265132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168586
4533	NC_015184	TCG	2	6	265163	265168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4534	NC_015184	GTG	2	6	265201	265206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168586
4535	NC_015184	GAT	2	6	265218	265223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168586
4536	NC_015184	CAAT	2	8	265226	265233	50 %	25 %	0 %	25 %	325168586
4537	NC_015184	GCA	2	6	265275	265280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4538	NC_015184	CGG	2	6	265343	265348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4539	NC_015184	CGA	2	6	265356	265361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168586
4540	NC_015184	CGG	4	12	265371	265382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168586
4541	NC_015184	TGT	2	6	265410	265415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168586
4542	NC_015184	TC	3	6	265779	265784	0 %	50 %	0 %	50 %	325168587
4543	NC_015184	CCCT	2	8	265889	265896	0 %	25 %	0 %	75 %	325168587
4544	NC_015184	TGA	2	6	265899	265904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168587
4545	NC_015184	ACG	2	6	265908	265913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168587
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4548	NC_015184	TCAA	2	8	266504	266511	50 %	25 %	0 %	25 %	325168588
4549	NC_015184	CCGC	2	8	266521	266528	0 %	0 %	25 %	75 %	325168588
4550	NC_015184	TCG	2	6	266671	266676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168588
4551	NC_015184	TCG	2	6	266740	266745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168588
4552	NC_015184	CGA	2	6	266843	266848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168588
4553	NC_015184	CGGTC	2	10	266858	266867	0 %	20 %	40 %	40 %	325168588
4554	NC_015184	GCC	2	6	266880	266885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168588
4555	NC_015184	GGC	2	6	266942	266947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168588
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4557	NC_015184	CCGG	2	8	267005	267012	0 %	0 %	50 %	50 %	325168588
4558	NC_015184	GGC	2	6	267044	267049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168588
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4560	NC_015184	CTG	2	6	267284	267289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168589
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4562	NC_015184	GTT	2	6	267404	267409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168589
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4564	NC_015184	GC	3	6	267533	267538	0 %	0 %	50 %	50 %	325168590
4565	NC_015184	CGTC	2	8	267590	267597	0 %	25 %	25 %	50 %	325168590
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4569	NC_015184	TGGA	2	8	267766	267773	25 %	25 %	50 %	0 %	325168590
4570	NC_015184	ACG	2	6	267798	267803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168590
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4573	NC_015184	CGA	2	6	267986	267991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168590
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4588	NC_015184	ATG	2	6	268671	268676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168591
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4591	NC_015184	AGGA	2	8	268788	268795	50 %	0 %	50 %	0 %	325168591
4592	NC_015184	CG	3	6	268897	268902	0 %	0 %	50 %	50 %	325168591
4593	NC_015184	CACG	2	8	268985	268992	25 %	0 %	25 %	50 %	325168591
4594	NC_015184	GGC	2	6	268997	269002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168591
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4598	NC_015184	GCCG	2	8	269120	269127	0 %	0 %	50 %	50 %	325168591
4599	NC_015184	CTGG	2	8	269134	269141	0 %	25 %	50 %	25 %	325168591
4600	NC_015184	GCC	2	6	269175	269180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168591
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4602	NC_015184	TCGA	2	8	269282	269289	25 %	25 %	25 %	25 %	325168591
4603	NC_015184	CCGA	2	8	269290	269297	25 %	0 %	25 %	50 %	325168591
4604	NC_015184	TGC	2	6	269320	269325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168591
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4608	NC_015184	GC	3	6	269629	269634	0 %	0 %	50 %	50 %	325168591
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4610	NC_015184	GC	3	6	269723	269728	0 %	0 %	50 %	50 %	325168591
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4612	NC_015184	TCGA	2	8	269826	269833	25 %	25 %	25 %	25 %	325168592
4613	NC_015184	CG	3	6	269942	269947	0 %	0 %	50 %	50 %	325168592
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4622	NC_015184	CGAG	2	8	270445	270452	25 %	0 %	50 %	25 %	325168592
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4848	NC_015184	GCG	2	6	282217	282222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168601
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4850	NC_015184	CGC	3	9	282502	282510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168602
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4853	NC_015184	ATCAA	2	10	282604	282613	60 %	20 %	0 %	20 %	325168603
4854	NC_015184	GC	3	6	282620	282625	0 %	0 %	50 %	50 %	325168603
4855	NC_015184	GCT	2	6	282637	282642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168603
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4857	NC_015184	TCG	2	6	282841	282846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168604
4858	NC_015184	CCGA	2	8	282859	282866	25 %	0 %	25 %	50 %	325168604
4859	NC_015184	GA	3	6	283048	283053	50 %	0 %	50 %	0 %	325168604
4860	NC_015184	AGAGA	2	10	283122	283131	60 %	0 %	40 %	0 %	325168605
4861	NC_015184	CATA	2	8	283235	283242	50 %	25 %	0 %	25 %	325168605
4862	NC_015184	GCC	2	6	283379	283384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168605
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4864	NC_015184	CG	3	6	283486	283491	0 %	0 %	50 %	50 %	325168605
4865	NC_015184	GTCC	2	8	283503	283510	0 %	25 %	25 %	50 %	325168605
4866	NC_015184	TGCC	2	8	283761	283768	0 %	25 %	25 %	50 %	325168606
4867	NC_015184	CAT	2	6	283819	283824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168606
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4985	NC_015184	ATC	2	6	290877	290882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168615
4986	NC_015184	TCC	2	6	290884	290889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168615
4987	NC_015184	GTC	2	6	290964	290969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168615
4988	NC_015184	GTC	2	6	291030	291035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168615
4989	NC_015184	TGC	2	6	291074	291079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168615
4990	NC_015184	ATG	2	6	291138	291143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168615
4991	NC_015184	CGC	2	6	291260	291265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168615
4992	NC_015184	GAC	2	6	291360	291365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168615
4993	NC_015184	GGA	2	6	291410	291415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168615
4994	NC_015184	CGA	2	6	291494	291499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168615
4995	NC_015184	A	6	6	291499	291504	100 %	0 %	0 %	0 %	325168615
4996	NC_015184	AGA	2	6	291511	291516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168615
4997	NC_015184	ACGG	2	8	291527	291534	25 %	0 %	50 %	25 %	325168615
4998	NC_015184	GAG	3	9	291597	291605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168615
4999	NC_015184	TGG	2	6	291634	291639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168615
5000	NC_015184	GAC	3	9	291665	291673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168615

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